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WORKSHOP

Workshop: "Angewandte Bioinformatik"

Anwendungsorientierter Einführungskurs für Studenten, Absolventen und Interessierte chemischer und biowissenschaftlicher Studienrichtungen

22. und 23. März 2012

Teilnahmegebühr: keine

Inhaltlicher Schwerpunkt des Workshops ist die Einführung in ausgewählte Methoden der Bioinformatik durch Vorträge und praktische Übungen. Zielgruppen sind Mitarbeiter, Studenten und Absolventen der biowissenschaftlichen und chemischen Studiengänge und an dieser Thematik Interessierte aus anderen Fachbereichen. Biochemische und biologische Grundkenntnisse werden vorausgesetzt. Ziel des Workshops ist der sichere Umgang mit den wichtigsten im Internet frei verfügbaren Bioinformatik - Ressourcen.

Der Workshopfindet an beiden Tagen  von 8.30 bis ca. 17.00 Uhr statt.

Referenten:
Prof. Dr. Thomas Rattei, Full Professor, University of Vienna, Department of Computational Systems Biology
Dr. Naumann, Mitarbeiter am Lehrstuhl für Allgemeine Biochemie der TU Dresden

Veranstalter: TU Dresden, Lehrstuhl für Allgemeine Biochemie, Neubau - Chemische Institute, Bergstraße 66

Veranstaltungsort: TU Dresden, CIP-POOL Beyer Bau Nr. 73

Anmeldeschluss: 15. Februar 2012

Für Studenten des Bachelorstudienganges Chemie, die am Praktikum Biochemie 1 teilnehmen,
ist keine gesonderte Anmeldung erforderlich.

Anmeldung oder Rückfragen an: Dr. Wolfgang Naumann

Mail: wolfgang.naumann@chemie.tu-dresden.de

Telefon: +49 351 463 34631

Zeit- und Themenplan zum Workshop "Angewandte Bioinformatik"

   Donnerstag, 22. März: 8.30 bis 17.00 Uhr

    "Biologische Datenbanken mit praktischen Übungen"

  • Einführung
  • DNA - Sequenzierung
  • Wichtige Sequenzdatenbanken
  • Recherchestrategien, Retrieval-Systeme
  • Paarweises Alignment und schnelle Suche in Datenbanken
  • Statistische Bewertung von Suchergebnissen und Alignments

   Freitag, 23. März: 8.30 bis 17.00 Uhr

    "Proteinstruktur- und Funktionsvorhersage"

  • Funktionsvorhersage mit Sequenzalignment
  • Positionsspezifische Sequenzkonservierung
  • Proteindomänen
  • Strategien zur Strukturvorhersage
  • homologiebasierte Strukturvorhersage
  • Faltungsvorhersage
  • abinitio Modellierung

  Mittagspause an beiden Tagen: 12.00 bis 13.00 Uhr

Scripte

Vortrag: Bioinformatik   

                                                                                                                                                                                               
W. Naumann, A. Lang, Letzte Änderung: 28.03.2012                                    Impressum